Reuna Debian

Sobre lo que preguntas de programación en Debian como te dijo Rudy si lo que buscas es crear programas para Linux es casi lo mismo en cualquier Linux. Solo cuando ya vayas a un nivel muy avanzado podras estar en capacidad de captar detalles del tipo "esta distribución usa la versión tal de tal biblioteca que no tiene la API tal que yo estaba usando" pero como te digo eso es ya bastante mas allá de iniciarse en la programación.

No creo que estes en este momento interesado en saber como programar el instalador de Debian o en hackear las herramientas específicas de debian como apt ó dpkg. Así que para el resto de la respuesta asumiremos que tu solo deseas "programaar en linux".

Lo que yo creo que debes definir bien es por donde comenzar. Tutoriales en la web hay muchos. Si puedes leer inglés sin problemas vas a encontrar muchos más, quizás los mejores.

En mi opinión tienes que escoger inicialmente entre alguno de estos grandes mundos:

1.- El mundo de la programación en C, que implica mucho conocer tambien las autotools, el comando make, y todas esas cosas. Hay libros bastante específicos sobre eso. Más allá de un curso generla de "C" deberás familiarizarte mucho con glibc y con glib. Luego, el complemento ideal seria programación con las bibliotecas GTK+ y GNOME.
Como "IDE" puedes usar el "Anjuta".

2.- El mundo de la programación en C++. Aqui te puedes instalar el KDevelop y usarlo como tu "IDE" y te va ser bastante facil ya que tiene muchas herramientas y ayudas de la API integrado. Asegúrate de conocer bien el lenguaje C++ primero, antes de entrar en el conocimiento de las bibliotecas de Qt y KDE.

3.- Programación en Python. Esta es una excelente opción para comenzar porque es un lenguaje muy potente, de muy alto nivel y con manejo dinámico de memoria. Cada vez los expertos coinciden mas en señalar que Python es hoy en dia uno de los lenguajes mas interesantes y cada vez se ven mas proyectos importantes escritos en Python. Un gran complemento es PyGTK, para la programación GTK+ y GNOME. No es un reemplazo a C ó C++ ya que no creas ejecutables ni puedes programar a bajo nivel, pero hoy en dia no tiene mucho sentido pedir eso si tu aplicación es para un usuario final, solo cuando escribes librerías de bajo nivel.

4.- Programación en C# usando Mono. Esta es la opción que ahora prefieren muchos de los que antes usaban C para programar en GNOME. C# es un gran lenguaje y tiene muchos conceptos de última generación. El esfuerzo del equipo de Miguel de Icaza hace que vayan casi a la par con las versiones de Micro$oft. Es un lenguaje de alto nivel con manejo dinámico de memoria y definitivamente va a ser mas facil de programar que C ó C++. Las principales criticas a C# y Mono no van por el lado técnico sino por el lado de legal y de patentes, ya que existe un cierto grado de temor de que Microsoft algun dia haga problemas en el futuro.

En todos los entornos mencionados hay full documentación y tutoriales.. es cosa de que busques en Google.

Quizas con mas calma otro dia puede publicar esto mismo en forma de un artículo en el portal.